底座是燕窝粘在石壁或者燕屋木板上的部分。金丝燕筑巢时为了令窝更牢固，通常会在底座吐大量的唾液，因此底座的唾液浓度较高，质感也会较硬。

天然燕窝的底座相当于金丝燕家中的“地基”，对燕窝有固定的作用。由于燕窝底座是燕窝与石壁或木板的衔接处，因此刚采摘的燕窝底座上也会夹杂着一些木屑或沙子，有些燕窝商为了美观，会剪掉一部分的底座。

理论上讲，燕窝的任何部位或者形态，营养成份均是相同的，不论是燕角、燕窝底座、燕碎还是燕条。

然而，燕窝可能存在人造或者补碎增重的情况，且补碎增重的燕窝，可能来源于化工手段获得，燕碎已经被钙化。

所以，燕窝的底座是否有营养，也要看底座是否有补碎的情况，而且补碎的来源是否天然。但是，除去人工干预的影响，燕窝的任何部位，其实营养成份都是相同的。